La Marouette de Baillon est caractérisée par des sous-caudales noires barrées de blanc ainsi qu’un plumage gris ardoise sur le dessous (gorge, face et poitrine) et brun marqué de lignes noires et blanches sur le dessus. Les flancs sont rayés de noir et de blanc .
Contrairement à la Marouette poussin, son bec est d’une seule couleur (celui de la marouette poussin présente du rouge au niveau des commissures) ; ses projections primaires sont également plus courtes que celles de la Marouette poussin.